|
|
Analysis of autenthicity of food products with fruit component
Prachárová, Adriana ; Mikulíková, Renata (oponent) ; Márová, Ivana (vedoucí práce)
The aim of this thesis was to determine the authenticity of fruit food for infants using molecular and instrumental methods. In the experimental part, plant DNA isolations from fruit leaves (peaches, apricots, plums and apples) and bananas were performed. Further, DNA was isolated also from five commercial products, and from model mixtures that were prepared in terms of content identical to the commercial mixtures. The isolated DNA was characterized and verified by qPCR with plant DNA-specific ITS2 primers. Three triple primer pairs were selected, and their specificity was evaluated when performing multiplex PCR. This method makes it possible to detect more types of fruit in one reaction, reducing the economic and time requirements for detection. As none of the selected primer pairs were sufficiently specific for the apricot, the evidence from the plum and peach was further realized using duplex PCR. High resolution melting curve analysis was used for better DNA type recognition. Subsequently, agarose gel electrophoresis was performed to analyse the fragment lengths. Furthermore, experiments have been made to identify some specific phenolic substances in commercial and model fruit mixtures by HPLC. Since phenolic substances are degradable under unsuitable storage conditions, the presence of individual compounds was not detected by this method.
|
|
|
Důkaz vybraných druhů červeného ovoce v potravinách rostlinného původu pomocí multiplex PCR a instrumentálních metod
Vybíralová, Natálie ; Langová, Denisa (oponent) ; Fialová, Lenka (vedoucí práce)
Stále častěji se potraviny stávají předmětem falšování, výjimkou nejsou ovocné výrobky, které obsahují jahody, borůvky a maliny. Tato bakalářská práce je zaměřena na detekci jahod, borůvek a malin v modelových i reálných ovocných produktech pomocí multiplex PCR a HPLC. Teoretická část pojednává o složení červeného ovoce, jeho významu ve výživě člověka a především o izolaci DNA z rostlinného materiálu. Cílem experimentální části práce byla analýza vybraných komerčních ovocných pyré obsahujících maliny, jahody a borůvky a jejich replik pomocí vybraných instrumentálních a molekulárně-biologických metod a následné srovnání výsledků těchto metod. Komerční ovocná pyré byla zakoupena v maloobchodní síti a modelové směsi (repliky těchto pyré) byly připraveny v laboratoři. Z ovocných pyré byla vyizolována DNA, která byla po potvrzení její amplifikovatelnosti úspěšně využita v multiplex PCR pro důkaz malin, jahod a borůvek.V instrumentální části byly pomocí HPLC u modelových a komerčních směsí detekovány určité látky specifické pro červené ovoce.
|
|
|
Detekce bakterií rodu Xanthomonas patogenních pro rajče a papriku metodou multiplex PCR
RAGOZINA, Mariia
Předmětem této bakalářské práce je optimalizace multiplex PCR pro detekci patogenních bakterií rodu Xanthomonas. Spoužitím primerových párů Bs-Xg (Koenraadt et al., 2007), Bs-Xp (Koenraadt et al., 2007), Xe_330CG1,2 (Stehlíková a Beran, nepublikováno) a Xv_367CG1-1,9 (Stehlíková a Beran, nepublikováno) byla úspěšně optimalizována multiplex PCR reakce pro detekci Xanthomonas gardneri, Xanthomonas perforans, Xanthomonas euvesicatoria a Xanthomonas vesicatoria v jedné reakci. Vybrané primerové páry byly testované na rozsáhlém souboru jiných bakterií patogenních pro rajče a papriku.
|
|
|
Development of methods for genetic analysis of plant foods
Fialová, Lenka ; Brázda, Václav (oponent) ; Doškař, Jiří (oponent) ; Márová, Ivana (vedoucí práce)
Multiplex real-time PCR-HRM je analytická metoda, která v posledních letech získává pozornost. Našla si využití např. v diagnostických aplikacích, při kontrole bezpečnosti potravin, i při ověřování jejich autenticity. Optimalizovaná multiplex PCR reakce dokáže poskytnout stejné informace jako odpovídající singleplex PCR reakce za výrazně kratší dobu. První část této práce byla zaměřena na izolaci DNA jak z čerstvého ovoce, tak i z vybraných průmyslově zpracovaných potravin. Na čerstvém ovoci bylo testováno šest různých metod pro izolaci DNA – tři kolonkové kity, dva kity s magnetickými nosiči a jedna konvenční metoda. Z těchto metod byla vybrána jedna, která byla využita pro izolace DNA z různých typů potravin rostlinného původu. Posledně zmíněné experimenty zahrnovaly i optimalizaci zvolené metody. Druhá část této práce byla zaměřena na vývoj triplex PCR metody pro simultánní detekci borůvek, malin a jahod ve vybraných potravinách. Během izolace DNA se chlorid vápenatý ukázal jako vhodný prostředek k odstranění pektinu ze vzorků, a v několika komerčních výrobcích byla prokázána přítomnost malin pomocí sigleplex PCR, ale z naměřených dat byl vyvozen závěr, že pro získání spolehlivějších výsledků jsou potřebné další optimalizace vyvinuté triplex PCR metody.
|
|
|
Analysis of autenthicity of food products with fruit component
Prachárová, Adriana ; Mikulíková, Renata (oponent) ; Márová, Ivana (vedoucí práce)
The aim of this thesis was to determine the authenticity of fruit food for infants using molecular and instrumental methods. In the experimental part, plant DNA isolations from fruit leaves (peaches, apricots, plums and apples) and bananas were performed. Further, DNA was isolated also from five commercial products, and from model mixtures that were prepared in terms of content identical to the commercial mixtures. The isolated DNA was characterized and verified by qPCR with plant DNA-specific ITS2 primers. Three triple primer pairs were selected, and their specificity was evaluated when performing multiplex PCR. This method makes it possible to detect more types of fruit in one reaction, reducing the economic and time requirements for detection. As none of the selected primer pairs were sufficiently specific for the apricot, the evidence from the plum and peach was further realized using duplex PCR. High resolution melting curve analysis was used for better DNA type recognition. Subsequently, agarose gel electrophoresis was performed to analyse the fragment lengths. Furthermore, experiments have been made to identify some specific phenolic substances in commercial and model fruit mixtures by HPLC. Since phenolic substances are degradable under unsuitable storage conditions, the presence of individual compounds was not detected by this method.
|
|
|
Důkaz vybraných druhů červeného ovoce v potravinách rostlinného původu pomocí multiplex PCR a instrumentálních metod
Vybíralová, Natálie ; Langová, Denisa (oponent) ; Fialová, Lenka (vedoucí práce)
Stále častěji se potraviny stávají předmětem falšování, výjimkou nejsou ovocné výrobky, které obsahují jahody, borůvky a maliny. Tato bakalářská práce je zaměřena na detekci jahod, borůvek a malin v modelových i reálných ovocných produktech pomocí multiplex PCR a HPLC. Teoretická část pojednává o složení červeného ovoce, jeho významu ve výživě člověka a především o izolaci DNA z rostlinného materiálu. Cílem experimentální části práce byla analýza vybraných komerčních ovocných pyré obsahujících maliny, jahody a borůvky a jejich replik pomocí vybraných instrumentálních a molekulárně-biologických metod a následné srovnání výsledků těchto metod. Komerční ovocná pyré byla zakoupena v maloobchodní síti a modelové směsi (repliky těchto pyré) byly připraveny v laboratoři. Z ovocných pyré byla vyizolována DNA, která byla po potvrzení její amplifikovatelnosti úspěšně využita v multiplex PCR pro důkaz malin, jahod a borůvek.V instrumentální části byly pomocí HPLC u modelových a komerčních směsí detekovány určité látky specifické pro červené ovoce.
|
|
|
Mikrosatelitní panel pro srnčí zvěř a jeho využití
Podlipná, Eliška
Bakalářská práce, jak už napovídá název Mikrosatelitní panel pro srnčí zvěř a jeho využití, se zabývá analýzou mikrosatelitních markerů srnčí zvěře. Cílem práce bylo sestavit mikrosatelitní panel pro srnčí zvěř a otestovat ho. Dále zjistit genetickou variabilitu srnčí zvěře na území ŠLP Křtiny a zjistit, zda překážky jako železniční trať, řeka nebo silnice představují pro srnčí zvěř migrační bariéru. V letech 2017-2018 bylo na území ŠLP Křtiny nasbíráno 40 vzorků srnčí zvěře. Vzorky byly analyzovány pomocí sedmi mikrosatelitních markerů, pro které byla optimalizována multiplex PCR. Pomocí statistických analýz bylo zjištěno, že na území ŠLP Křtiny se nachází pouze jedna populace srnce obecného a vnitrodruhové rozdíly jsou na úrovni jedince, nikoli na úrovni potenciálních skupin. Železniční trať, řeka ani silnice nepředstavují bariéru pro migraci srnčí zvěře ani pro tok genetické informace. Pro další studie navrhuji, aby byl rozšířen mikrosatelitní panel i území odběru vzorků (např. z různých částí ČR).
|
|
|
Vyšetření mikrodelecí chromozomu Y u mužů z neplodných párů
VELÍŠKOVÁ, Taťána
V poslední době se nejpopulárnějším tématem stává právě neplodnost. Kaţdým rokem se plodnost muţů sniţuje. Pří?inou můţe být špatná ţivotospráva, kouření, uţívání alkoholu a drog. Dále to mohou být i chemické látky, které se dostávají do potravy a vody. Další skupinou faktorů muţské neplodnosti jsou vlivy, které vedou k zahřívání varlat, optimální teplota je okolo 32 °C. Muţi, kteří nosí těsné prádlo a mají sedavé zaměstnání, jsou prokazatelně méně plodní. U mikrodelecí chromozomu Y se vyšetřuje dlouhé raménko Y chromozomu na AZF lokusu, kde jsou regiony AZFa, AZFb, AZFc. Delece na těchto pozicích jsou zodpovědné za poruchu tvorby a zrání spermií a jsou přenosné na muţské potomstvo. V důsledku chybění některé z oblasti AZF můţe docházet k oligospermii nebo azoospermii. Cílem bakalářské práce bylo optimalizovat metodu multiplex PCR pro vyšetření mikrodelecí v azoospermické oblasti chromozomu Y (AZFa, AZFb, AZFc) a vyhodnotit získaná data. V teoretické ?ásti jsou charakterizovány onemocnění týkající se neplodnosti muţů, například azoospermický faktor, Klinefelterův ?i Kallmanův syndrom. V praktické ?ásti bylo vyšetřeno ze stěru bukální sliznice 14 vzorků získaných od muţů. Všechny vzorky byly negativní, tudíţ všichni muţi byli plodní. S podezřením na jednoho neplodného muţe.
|
|
| |
host ::
RSS.